Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxd1Q01822 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxd1Q01822 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxd1Q01822 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxd1Q01822 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hoxd1Q01822 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd1Q01822 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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