Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top2aQ01320 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms