Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Col1a2Q01149 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms