Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbp1Q00915 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbp1Q00915 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms