Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apoa1Q00623 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apoa1Q00623 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms