Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pax8Q00288 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pax8Q00288 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms