Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp9bP98195 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms