Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cds1P98191 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cds1P98191 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms