Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfcP97953 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms