Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scn1bP97952 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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