Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca2P97929 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca2P97929 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms