Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cry1P97784 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cry1P97784 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms