Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd3P97770 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms