Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nbr1P97432 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nbr1P97432 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms