Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms