Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim43bP86448 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim43bP86448 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms