Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbx1P82976 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbx1P82976 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbx1P82976 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms