Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nucb2P81117 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms