Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx2P81066 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms