Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr1bP70700 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr1bP70700 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms