Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb1P70662 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb1P70662 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms