Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ext2P70428 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms