Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shox2P70390 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shox2P70390 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shox2P70390 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shox2P70390 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shox2P70390 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms