Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smad1P70340 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms