Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stra8P70278 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms