Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SnrpnP63163 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpnP63163 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms