Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd1P62315 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd1P62315 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms