Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap1s1P61967 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms