Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snap25P60879 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snap25P60879 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snap25P60879 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms