Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ppfia3P60469 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms