Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Setd4P58467 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Setd4P58467 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms