Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Strn4P58404 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms