Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dpf3P58269 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dpf3P58269 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms