Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samsn1P57725 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samsn1P57725 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms