Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NcstnP57716 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NcstnP57716 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms