Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bace1P56818 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bace1P56818 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms