Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lim2P56563 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms