Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CartptP56388 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CartptP56388 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CartptP56388 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CartptP56388 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CartptP56388 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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CartptP56388 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CartptP56388 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CartptP56388 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CartptP56388 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CartptP56388 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CartptP56388 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CartptP56388 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CartptP56388 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms