Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn2bP55271 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms