Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtskP55097 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtskP55097 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtskP55097 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtskP55097 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtskP55097 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtskP55097 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtskP55097 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms