Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NcanP55066 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NcanP55066 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NcanP55066 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NcanP55066 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NcanP55066 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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