Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ephb3P54754 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ephb3P54754 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms