Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Faf1P54731 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Faf1P54731 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms