Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PctpP53808 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PctpP53808 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PctpP53808 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PctpP53808 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PctpP53808 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms