Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RabggtbP53612 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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