Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Map3k1P53349 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Map3k1P53349 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms