Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lbx1P52955 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lbx1P52955 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms