Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rhox5P52651 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms