Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gpc4P51655 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gpc4P51655 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms