Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnnt2P50752 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnt2P50752 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms